WCS-systemet er ansvarlig for planleggingen mellom systemet og utstyret, og sender kommandoene gitt av WMS-systemet til hvert utstyr for koordinert drift. Det er kontinuerlig kommunikasjon mellom utstyret og WCS-systemet. Når utstyret fullfører oppgaven, utfører WCS-systemet automatisk datapostering med WMS-systemet.